Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Phf11bB4XVQ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Phf11bB4XVQ1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Phf11bB4XVQ1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms