Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usf3B2RUQ2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms