Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf518aB2RRF6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms