Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Znf518bB2RRE4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf518bB2RRE4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms