Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp42B2RQC2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp42B2RQC2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp42B2RQC2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp42B2RQC2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp42B2RQC2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp42B2RQC2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp42B2RQC2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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