Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Zbed5B2RPU8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Zbed5B2RPU8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Zbed5B2RPU8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms