Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms