Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms