Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rtf1A2AQ19 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Rtf1A2AQ19 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtf1A2AQ19 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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