Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Syndig1A2ANU3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Syndig1A2ANU3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms