Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ambra1A2AH22 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ambra1A2AH22 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ambra1A2AH22 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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