Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap5A2AGT5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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