Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc163A2AGD7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms