Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5538W4VSP6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms