Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms