Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn6Q9Z262 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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