Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms