Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pfdn5Q9WU28 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pfdn5Q9WU28 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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