Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trpc2Q9R244 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms