Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc1Q9QZF2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gpc1Q9QZF2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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