Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rdh11Q9QYF1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms