Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Csnk1eQ9JMK2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms