Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms