Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tlr5Q9JLF7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tlr5Q9JLF7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tlr5Q9JLF7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tlr5Q9JLF7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms