Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trem1Q9JKE2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trem1Q9JKE2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms