Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra4Q9JJT2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms