Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Riox1Q9JJF3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms