Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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