Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms