Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tlr1Q9EPQ1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Tlr1Q9EPQ1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr1Q9EPQ1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms