Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rnft1Q9DCN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms