Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pop7Q9DCH2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms