Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hmgn3Q9DCB1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hmgn3Q9DCB1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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