Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc89Q9DA73 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc89Q9DA73 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc89Q9DA73 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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