Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp12Q9D9M2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp12Q9D9M2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp12Q9D9M2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp12Q9D9M2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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