Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot8Q9D8X5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms