Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms