Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chmp5Q9D7S9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp5Q9D7S9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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