Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Tmem54Q9D7S1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem54Q9D7S1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms