Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7Q9D541 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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