Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms