Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcc1Q9D4H2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms