Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx29Q9D3S3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx29Q9D3S3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Snx29Q9D3S3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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