Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pramef12Q9D2F1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Pramef12Q9D2F1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pramef12Q9D2F1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pramef12Q9D2F1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pramef12Q9D2F1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms