Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mms19Q9D071 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Mms19Q9D071 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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