Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp2Q9CYZ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssbp2Q9CYZ8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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