Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms