Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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PmpcbQ9CXT8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PmpcbQ9CXT8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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