Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rhobtb3Q9CTN4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms