Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Polr3kQ9CQZ7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Polr3kQ9CQZ7 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms